Par ses actions d'aménagement et de gestion des cours d'eau, l'Entente Oise-Aisne contribue principalement à la lutte contre les inondations.

Elle participe également à la préservation de l'environnement naturel du bassin hydrographique de l'Oise, de l'Aisne et de leurs affluents sans modifier la vocation existante des espaces concernés, sauf s'il s'agit de mettre en place des dispositifs de lutte contre les inondations. Sa mission est de conduire des politiques voulues et partagées par les départements membres avec comme objectif de tout mettre en œuvre pour trouver les voies et moyens compatibles. Le programme d’aménagement pour les années 2007-2013, élaboré dans la parfaite continuité du programme 2000-2006 est soutenu par l’ensemble de nos partenaires (Etat/Régions). Il inclut 7 sites à réaliser.
Le programme d’intervention permet à l’Entente d’établir progressivement un maillage hydraulique de l’ensemble du bassin. Les simulations effectuées confirment d’ailleurs le bien-fondé de cette stratégie de ralentissement dynamiques des crues et son efficacité à terme.

En 2008, une reconnaissance effective de l’établissement en tant qu’ EPTB

La Directive cadre sur l’eau invite les acteurs concernés des Etats membres, dont l’Entente fait partie, à joindre leurs efforts pour atteindre le bon état des eaux à l’horizon 2015. Cet objectif ambitieux nécessite plus que jamais une gestion de l’eau et des milieux cohérente et concertée, et ce, à l’échelle hydrographique la plus pertinente possible. La reconnaissance des EPTB est intervenue dans le Code de l’Environnement, modifié par différents textes récents : la loi du 30 juillet 2003 sur les risques technologiques et naturels a modifié l’article 213-10 du code de l’Environnement et prévoit désormais que : « pour faciliter à l’échelle du bassin ou d’un sous-bassin hydrographique la prévention des inondations et la gestion équilibrée de la ressource en eau, les collectivités territoriales intéressées et leurs groupements peuvent s’associer au sein d’un établissement public territorial de bassin. »
L’Entente, de par son positionnement hydrographique cohérent et ses missions statutaires, a un rôle central à jouer dans cette coordination des politiques de gestion sur son périmètre d’intervention. En effet, l’Entente intervient d’ores et déjà sur les thématiques fondamentales liées à la gestion de l’eau et cadrant les fonctions de coordinateur de grands travaux qu’occupent les EPTB.
Par conséquent, après une longue phase de discussion, les membres du Conseil d’administration, par délibération du 13 décembre 2007, ont majoritairement approuvé la demande de reconnaissance de l’institution en tant qu’Etablissement public territorial de bassin sur un périmètre hydrographique d’intervention pertinent.